Quelle que soit la renommée, Carracci apporta ses peintures “païennes” du Palazzo Farnese, mais la plupart des œuvres qu’il écrivit néanmoins sur des sujets religieux traditionnels. De 1584 à 1595, il a créé pas mal de grandes images d’autel, démontrant une augmentation progressive des compétences. Après 1595, l’artiste a peint relativement peu de tableaux religieux.
Occupé à peindre la galerie Farnese, il n’a trouvé le temps que pour de petites œuvres. L’un des chefs-d’œuvre de cette période était le tableau “Trois Marie au Sépulcre”. Par la suite, cet “incomparable”, selon l’un des biographes du maître, le tableau a été acquis par le roi d’Angleterre Charles I.
En outre, plusieurs triptyques appartiennent à la période romaine, y compris une œuvre expressive telle que Descente de croix. À la fin de sa vie, Carracci recommence à créer des compositions pour de grandes images d’autel, mais les confie à ses élèves.