Además de la serie de frescos en la Capilla de la Arena, los únicos frescos que nos han llegado, que se atribuyen con confianza a Giotto, son obras que adornan las Capillas Bardi y Peruzzi en Florencia.
En la Capilla Bardi, se conservan siete frescos que representan escenas de la vida de San Francisco. En la capilla de Peruzzi sobrevivieron seis frescos: tres con la imagen de San Juan Bautista y tres más dedicados a la vida de Juan el Divino. En el siglo XVIII, todos fueron pintados con pintura blanca.
Una tumba estaba pegada a una pared con un mural que representa la muerte de San Francisco. En la década de 1950, estas obras de Giotto se sometieron a una restauración a fondo. Desafortunadamente, en algunos casos, el efecto destructivo del tiempo ha sido irreversible.
Esto se ve especialmente bien en el fresco “Herencia de Herodes” en la Capilla Peruzzi.
Los frescos en la Capilla Bardi se ven mucho más expresivos. Todas estas obras datan de los años 1320.