Sous le roi Ferdinand d’Aragon, l’influence de l’Inquisition s’intensifia. En avril 1484, à Tarason, les cortes du royaume d’Aragon, en conseil secret composé de personnes appelées par le roi, sont nommées au poste d’inquisiteur en chef du royaume de Castille auprès de Thomas Torquemade. Thomas Torquemada a nommé les inquisiteurs du frère du diocèse de Saragosse Gaspar Huglar, moine dominicain, et le Dr Pedro Arbuez d’Epilou, chanoine de l’Église métropolitaine.
L’arrêté royal ordonne aux autorités provinciales de les aider. En mai et juin, les nouveaux inquisiteurs procèdent à plusieurs autodaphes publics et solennels et remettent à la cour laïque les malheureux accusés, qui sont brûlés. Ces exécutions agaçaient de plus en plus les nouveaux chrétiens du royaume d’Aragon, qui s’attendaient à voir bientôt la reprise parmi eux des scènes se déroulant en Castille, où le tribunal, créé il y a tout juste trois ans, avait déjà tué des milliers de victimes sous le contrôle de moines et prêtres fanatiques.
Les Aragonais ont vu que tous leurs efforts pour empêcher l’établissement de l’Inquisition parmi eux étaient futiles, et ont décidé de sacrifier un ou deux inquisiteurs afin d’en effrayer d’autres. Ils étaient convaincus qu’après cet événement, il n’y aurait plus de doute sur l’humeur populaire, que personne n’oserait devenir un inquisiteur, et le roi lui-même abandonnerait son intention initiale par peur des mouvements rebelles qui pourraient éclater en Castille et en Aragon. “Lorsque le projet d’assassinat des conspirateurs a été approuvé, ils ont commencé à chercher des assassins pour se débarrasser du Dr Pedro Arbuez d’Epila, le principal inquisiteur de Saragosse. Leurs tentatives d’assassinat ont échoué à plusieurs reprises. Pedro Arbuez, informé de cette intention, a pris des précautions pour être moins à risque.”
Pour se protéger des coups des tueurs, l’inquisiteur portait une cotte de mailles sous ses vêtements et quelque chose comme un casque de fer recouvert d’un bonnet rond. Au moment du meurtre dans l’église métropolitaine, il était agenouillé près d’une des colonnes de l’église, où se trouve maintenant un pupitre pour l’apôtre; sa lanterne se tenait à côté de lui, et un bâton épais était appuyé contre la colonne. Le 15 septembre 1485, après onze heures du soir, tandis que le chanoine de l’autel de l’église récitait les prières du matin, Juan d’Esperaindeo, armé d’une épée, s’approcha de lui, le frappa durement avec une lame à la main gauche. Vidal d’Uranso, averti par Juan d’Abadia qu’il devait être frappé au cou, le frappa par derrière, déchirant le casque et lui fit une blessure si profonde à la tête que l’Inquisiteur en mourut deux jours plus tard, soit le 17 septembre.
Le calcul politique l’a inspiré, comme Isabelle, à honorer la mémoire d’Arbuez avec une sorte de solennité, ce qui a grandement contribué à le faire passer pour un saint et à l’entourer d’un culte spécial dans les églises. Cela s’est produit beaucoup plus tard, lorsque le pape Alexandre VII, le 17 août 1664, a classé Arbues comme un bienheureux, comme un martyr de la foi. Et en temps voulu, une magnifique tombe lui a été érigée, et son corps a été déposé dessus le 8 décembre 1487. “